Molecular Dynamics Simulation of
Water and Hydrate by TIP5P Model

 

 水分子やハイドレートのシミュレーションを,高い精度をもつ
TIP5Pモデル(第2世代の分子動力学コード) を使い行っている。
質点の並進運動と回転運動で,クーロン力による5点の原子
水分子の運動を表す。水分子の反発力であるLennard-Jones
ポテンシャルとしては幾つかのモデルがあり,TIP5P-Ewald法
を用いた。

 水・氷とメタンハイドレートのマイクロ波の電場を加えて,分子崩壊
をこのTIP5Pコードを用いて研究した。PDFファイルで, Figureが
示すように
, 水分子とメタンへの崩壊過程を示している。

 零度未満の氷(ice)は,マイクロ波オーブンでは融解しない!


by English


 A high accuracy code by the TIP5P water model is constracted
and shown at this page. Translational and rotatinal motions
of water by TIP5P are used. The shake/rattle code was the first
generation of codes. The collapse of methanhydrate molecules
is simulated by the TIP5P model. The codes for (i) relativistic,
(ii) implicit, (iii) water and hydrate, etc. in Fortran are written
at https://github.com/
Mtanaka77/ Link to Github

 
"Ice state is not melted by a microwave oven"
Tanaka and Sato, JCP (2007)


Water_and_hydrate_molecules_by_TIP5P_code.pdf
  
Simulation_of_methane_hydrate_by_TIP5P-Ewald_model.pdf

(Simulation results in arXiv Library)

Water_TIP5P_Simulation.pdf
  
(Numerical Coding - in PDF)

「物理化学の分子動力学法」 View PDF
 
Molecular Dynamics of Chemical Physics

References
1. H. Goldstein, C. Poole, J. Safko, Classical Mechanics
(3rd Edition, Pearson Education, England, 2006)

2. Microwave heating of water, ice and saline solution:
Molecular dynamics study, M. Tanaka and M. Sato,
J.Chem.Phys., 126, 034509 (2007).

3. Molecular dynamics simulations of ice and methane
hydrate by means of the rotation coordinate TIP5P-Ewald
model, M. Tanaka, arXiv 2311.01182, Cornell University
Library (2023).


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